马桶往往“安身”在阴暗、潮湿的洗手间内，很容易滋生细菌，针对这一情况，市场上出现了许多打着“抗菌”、“防菌”旗号的抗菌马桶。业内人士提醒消费者，选择抗菌马桶，关键要看釉面材料。
常见的制造抗菌陶瓷的方法，是将含银、锌、铜的抗菌剂加入陶瓷釉面，这种经特殊加工的釉面可有效抑制细菌；也有厂家推出了抗菌陶瓷制成的马桶，称之为“自洁”马桶，这种洁具采用先进的稀土、纳米技术，利用细胞分解原理来杀死细菌，还能使洁具附件空气中的负离子浓度增加，具有清新空气的作用。另外，还有一种智洁技术，在马桶表面涂上**釉料来形成“离子隔离壁”，由于釉料消除了容易藏污垢的空隙，所以即使有污物也很难黏附，从而杜绝了霉菌的产生。
马桶盖板、坐圈由于长时间使用，可能附着有大量的大肠杆菌、葡萄球菌等病菌。为此，近年来一些由抗菌材质制作的马桶盖板，它将抗菌物质与洁具材料融为一体，其中含有的无机离子，可以有效吸附细菌，在家庭装修中颇为实用。
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